Клинические признаки при различных вариантах мукополисахаридоза имеют значительное сходство и становятся заметными к двух-трехлетнему возрасту. Для МПС-4,6 не характерноснижение интеллекта. Для МПС-4 не характерны черты гаргоилизма. Диагностика МПС основывается на совокупности данных генеалогического анализа, клинических проявлений, рентгенологических данных, выведении с мочой оксипролина (снижение), гликозаминогликанов (ГАГ) и их фракций (превышение в 5-10 раз).
Точная идентификация типов МПС возможна только с помощью определения активности лизосомных гидролаз в лимфоцитах и лейкоцитах крови, культуре фибробластов кожи, биоптатов печени, а также в моче.
Признаки мукополисахаридоза изменяются в широких пределах от больного к больному. У пациентов проблемы с сердцем, легкими, пищеварительной системой, костно-мышечного аппарата и поражениями мозга, многие больные с мукополисахаридозом испытывают больше боли, чем обычные люди. В раннем детстве дети с тяжелой формой мукополисахаридоза могут быть гиперактивными, сильными, обычно очень веселыми, но очень быстро утомляемыми. У них занижена степень концентрации внимания, их интеллектуальный возраст ниже возраста физического развития. Такой ребенок может, например, запереть дверь ванной, но не способен понять, как выйти обратно, даже когда взрослый много раз ему объяснит. Они любят грубые разрушительные игры, создание шума и разбрасывание игрушек для таких детей скорее игра. Они могут не сознавать опасностей, упрямы и недисциплинированны, поскольку зачастую просто не могут понять, что от них требуется. Некоторые дети могут иметь вспышки агрессивного поведения. Некоторые могут какое-то время пользоваться туалетом, но большинство пользуется подгузниками. Дети с легкой формой мукополисахаридоза, как правило, полностью не отличаются в поведении от здоровых детей.